San José del Guaviare, la capital del departamento de Guaviare, se sitúa en la parte norte de esta división político-administrativa, en una extensión de 42 327 kilómetros cuadrados. La cabecera municipal está a 175 metros sobre el nivel del mar, aproximadamente a 400 km al sur de la ciudad de Bogotá. Su terreno es principalmente plano, correspondientes a la transición entre la Orinoquía y la Amazonía, y es regado por varios cursos de agua, entre los que destacan los ríos Guaviare y Guayabero